在药品生产中，为了保证药品的均匀度和良好的流动性，常将原料用一定的方法制成颗粒(药丸、胶囊、片剂)。利用微波的热效应和非热效应，进行低温干燥和杀菌处理，微波能量直接辐射到药品中，使药品内部温度升高，产生压力，加速被约束水分子的转移，被处理物品中的水份逐步向外蒸发，此时微波设备中再进行抽湿，将蒸发出来的水份带走。利用微波干燥处理药品不仅大大提高产品质量，并可大大缩短干燥时间和节约大量的能源，经济效益十分明显。
    此外，微波可对各种中、西药品、药材进行干燥、脱水、消毒、灭菌、杀虫、防霉处理。可大大方便生产厂家对药品和原材料的贮存和保管